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2006年胸外科独立建科，科室现有医护人员22人，其中主任医师1人，副主任医师2人，主治医师1人，医师1人，护理人员17人。科室与济宁第一人民医院、济医附院，山东省立医院、山东肿瘤医院等上级医院相关科室有长期合作，专家教授可远程会诊或莅临指导手术。
胸外科涉及广泛的疾病领域，如胸部外伤、肋骨骨折、血气胸、心脏损伤等，还包含胸部疾病，如胸壁肿物、胸膜肿物、肺部良恶性肿瘤、气管肿瘤、食管良恶性肿瘤、纵隔肿瘤等，同时涵盖乳腺外科领域，其中以肺外科和食道外科为主。
随着手术技术与器械的飞速发展，胸外科手术也从传统的大开胸、大刀口手术逐步发展为微创小切口手术。微创手术技术以精细、最准确的操作为特点，能够大限度地减少手术创伤，降低术后疼痛。由于微创手术对组织的损伤小，患者术后恢复迅速，可早期下床活动，缩短住院时间。我院胸外科在上级专家指导下，已成功开展胸腔镜下肺叶切除术、肺段切除术、肺楔形切除术、食管癌根治术、肋骨骨折切开复位内固定术、肺大泡切除术、纵隔肿瘤切除术等，手术技术日益成熟。
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